Bumagsak sa pagitan ng pangalawa at pangatlong prequel films, Star Wars: The Clone Wars detalyado ang salungatan na makakapag-rock ng galaxy sa mga pundasyon nito. Sa huli, dahil alam na alam ng mga tagahanga, ang balangkas ni Darth Sidious upang masiraan ang Jedi at ang Republika at kontrolin ang lahat ay matagumpay. Gayunpaman, sa panahon ng giyera, ang isang tao ay naging malapit sa pag-foil ng kanyang mga plano kaysa sa iba, kahit na hindi niya namalayan ito sa oras na iyon.
Si Padmé Amidala ay ipinakilala sa mga tagahanga sa Star Wars: The Phantom Menace bilang isang nahalal na Reyna ng Naboo. Matapos makumpleto ang kanyang termino bilang reyna, nagpatuloy siya sa paglilingkod sa kanyang planeta bilang isang kinatawan sa Galactic Senate on Coruscant. Nagpunta siya upang gampanan ang isang pangunahing papel sa pag-install ni Sheev Palpatine, na siyang Senador para kay Naboo nang siya ay nakaupo sa trono, bilang bagong Chancellor. Sa kasamaang palad para sa kalawakan, pinangunahan niya ang isang dobleng buhay sa ilalim ng pagkukunwari ni Darth Sidious.
Isinasaalang-alang na ang bahagi na ginampanan niya sa mga plano ni Palpatine ay hindi sinasadya nang mabuti, si Padmé ay naging isang mahalagang sangkap din sa pagsubok na wakasan ang giyera sa mga Separatist. Siya ay isang matibay na naniniwala na ang laban ay isang senaryo na walang panalo para sa magkabilang panig, at ang diplomatiko na paraan ay ang tanging paraan upang matigil ang tunggalian. Tama si Padmé sapagkat ang giyera ay inayos ni Palpatine, na lihim na tumatakbo sa magkabilang panig ng labanan.
Sa buong giyera, makakahanap si Padmé ng mga bagong paraan upang labanan laban sa giyera sa Senado. Lumikha siya ng mga panukalang batas na maglilimita sa paggastos sa kanilang Grand Army ng Republika habang ang lumalalang utang sa magkabilang panig ng hidwaan ay humina ng malaki sa kani-kanilang posisyon. Sumalungat din si Padmé sa utos ng Senado at nakakonekta sa isang kaibigan mula sa mga Separatist na si Mina Bonteri, na nais din ng kapayapaan. Kung na-out ito, maiwawaksi nito ang buong plano ni Palpatine.
Ang katotohanan ay ang iba't ibang mga pagkukusa ng Padmé na halos lahat ay nagtagumpay. Si Palpatine at ang kanyang mga flunkies ay kailangang pumunta sa matinding hakbang upang mapigilan siya mula sa hamstring ng kanilang operasyon, kasama na noong pinlano ni Count Dooku at pinatay ang pagpatay kay Bonteri, pagkatapos ay nagsimula ng isang pag-atake sa Coruscant upang mapahina ang mga paglilitis sa kapayapaan.
Kakatwa, lahat ng ginawa ni Padmé upang subukan at itigil ang giyera ay walang hanggan na mas epektibo kaysa sa anumang sinubukan ng Jedi. Ang mga pinaghihinalaang mga tagapayapa ay pinapayagan ang kanilang sarili na mahimok sa isang mamahaling salungatan na hinimok laban sa kanila mula sa simula, at ang lahat ng kanilang pagsisikap ay nilaro mismo sa mga kamay ng Sith Lord. Ito ay isang plano na dapat sana ay mapagtanto nila sa pamamagitan ng Force, ngunit nabulag sila ng kanilang sariling kayabangan.
Kung ang Jedi ay maaaring makalampas sa kanilang hubris, maaaring napagtanto nila ang isang plano na gumagalaw sa paligid nila nang mas maaga. Ang tunay na pangako ni Padmé sa isang mapayapang resolusyon ay ang pinakamalaking tinik sa panig ni Palpatine sa buong Clone Wars, kaya kung sinundan ng Jedi ang kanyang pamumuno sa halip na tumakbo sa labanan kasama ang isang hukbo na dinisenyo upang patayin sila, ang Order ay hindi madaling bumagsak.
